Фамилия Мюхинен на первый взгляд кажется иноязычной, и это действительно так: она имеет финские корни. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, образованных суффиксами -ов/-ев или -ин, модель на -нен указывает на восточно-финское происхождение, характерное для карелов, ингерманландцев и собственно финнов. Такие фамилии массово появились в XIX веке, когда финским крестьянам предписали закрепить наследственные родовые имена, и часто образовывались от названий мест, прозвищ или личных имён.

Основа фамилии — «Мюхин» — скорее всего, восходит к финскому прозвищному имени Möhkö или Möhky, которое могло означать угрюмого, молчаливого человека или же относиться к некоему звукоподражательному корню. В русском языке это имя могло трансформироваться в форму «Мюхин» через адаптацию финского звука ö (похожего на «ё») в более привычный «ю». Суффикс -ен (фин. -nen) в переводе означает «принадлежащий», «относящийся к» — то есть Мюхинен буквально значит «из рода Мюхиных» или «сын Мюхи».

Географически фамилия Мюхинен привязана к территориям бывшей Ингерманландии (ныне Ленинградская область) и Карельского перешейка. Носители такой фамилии — потомки ингерманландских финнов или карел, которые после советско-финской войны и депортаций 1930–1940-х годов оказались разбросаны по разным регионам России. Встречаются варианты написания «Мюхинен» и «Мюхёнен» — второй ближе к оригинальному финскому произношению (Möhkönen).

Таким образом, предки человека с фамилией Мюхинен были, вероятнее всего, крестьянами-земледельцами или рыбаками из приграничных с Финляндией районов. Фамилия не получила широкого распространения в центральной России и остаётся довольно редкой, что делает её ярким маркером этнической и региональной истории северо-запада.