Фамилия Мюлькали — один из тех редких случаев, когда написание почти полностью сохраняет исходное иноязычное звучание, а русская грамматика добавляет только окончание. В ней нет славянского суффикса -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на позднее и, скорее всего, нерусское происхождение.

Основа фамилии восходит к тюркскому или арабо-тюркскому слову «мюльк» (mülk). В османском и азербайджанском языках это слово означает «владение», «имущество», «земельная собственность». Чаще всего «мюльк» обозначал частное землевладение, в отличие от государственной или вакуфной земли. Второй элемент «-али» — это либо часть имени Али (очень распространённый компонент в мусульманских составных именах), либо указание на принадлежность («из рода Али»). Таким образом, Мюлькали можно прочитать как «владелец (земли) Али» или «принадлежащий к владению Али».

Словообразовательная модель здесь простая: тюркское имя или прозвище (Мюлькали) было напрямую заимствовано в русскую паспортную систему без переосмысления. Фамилия не склонялась по типу «Мюлькали — Мюлькалиева», а осталась в мужской форме с нулевым окончанием, что типично для фамилий тюркского происхождения, оформленных по русскому образцу как существительные мужского рода.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным тюркским и кавказским влиянием, где исторически была распространена система частного землевладения (мюлькадарства). Носители фамилии могли быть потомками мелких землевладельцев, мюлькадаров, или же людей, получивших прозвище по имени влиятельного родственника или предка по имени Али, владевшего землёй. Встречается фамилия в Азербайджане, Дагестане и среди татар, но в России она крайне редка.

Есть и более прозаичная версия: «Мюльк» могло быть просто личным именем (редкое, но встречающееся в некоторых тюркских диалектах), а «Али» — именем отца. Тогда фамилия строится по классической восточной формуле «имя + имя отца», что даёт значение «Мюльк, сын Али». В любом случае, перед нами не прозвище по профессии или внешности, а указание на социальный статус и родовую связь, застывшее в форме, почти не изменившейся с момента записи в метрическую книгу.