Фамилия Мюлюс — редкий пример прибалтийско-немецкого наследия в русском ономастиконе. Она образована от немецкого личного имени Müll, которое в свою очередь восходит к фамилии Müller — «мельник». В немецкой среде это одна из самых распространённых фамилий, но в русском контексте она приобрела необычное окончание -ус, указывающее на латинизированную или полонизированную форму. Скорее всего, фамилия Мюлюс появилась у остзейских немцев (жителей Прибалтики), которые часто адаптировали свои фамилии к местной языковой среде, добавляя латинские суффиксы -ус или -ис. Встречается и версия, что основа — литовское слово mulas (мул) или польское muł (ил, грязь), но это менее вероятно, учитывая типичное немецкое звучание корня «Мюль».

Географически фамилия Мюлюс закрепилась в Литве и западных губерниях Российской империи, где проживали немецкие колонисты и остзейское дворянство. Встречается она и в современной России, но крайне редко — носители разбросаны по разным регионам, без выраженного ареала. По сословной принадлежности предки Мюлюсов могли быть как городскими ремесленниками (мельниками или пекарями), так и мелкими дворянами — в Прибалтике немецкие фамилии носили и крестьяне, и помещики.

Словообразовательная модель проста: немецкая основа Müll- (от Müller) плюс латинский суффикс -us, который в русском языке превратился в окончание -ус. Встречаются варианты написания: Мюллюс, Мюлус, но классическая форма — именно Мюлюс, с умлаутом, переданным через «ю». В отличие от фамилий на -ов или -ин, эта не указывает на принадлежность отцу или роду занятий напрямую, а фиксирует прозвище или профессию предка в иноязычной форме.

Споров вокруг этимологии почти нет: основная версия — от Müller — общепринята. Редкая альтернатива — связь с эстонским mül (грязь) — не выдерживает критики, так как не объясняет суффикс. Таким образом, фамилия Мюлюс — компактный маркер миграции немецкой фамилии в восточноевропейское пространство, сохранивший свою латинизированную оболочку.