Фамилия Мзгипренская — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает происхождение. На первый взгляд она кажется искусственной или канцелярской, но на деле это почти наверняка искажённая запись фамилии Мзгипренский, которая образована от названия населённого пункта. В русской ономастике суффикс -ск- (в женской форме -ская) — верный признак дворянской, польской или церковной фамилии, указывающей на «выходца из…». Основа «Мзгипр-» не имеет смысла в русском языке, но если допустить, что в документах пропущена буква (например, «Мзгипренский» вместо «Мзгипревский» или «Мзгипровский»), то проясняется связь с гидронимом или топонимом, где корень «Мзг-» мог быть вариантом «Мзд-» или «Мзгл-». Сравните с рекой Мздынь в Тверской области или ойконимом Мзги (деревня в Псковской области, известная с XVI века). В таком случае фамилия Мзгипренская могла означать «та, что родом из села Мзгипры» — гипотетического поселения, которое не сохранилось в современных справочниках, но могло существовать в западных губерниях России или на территории современной Беларуси.

Другая версия, хоть и менее вероятная, — связь с прозвищем «Мзга» (от диалектного «мзга» — сырость, туман, мокреть, а также вялый человек). Но тогда фамилия должна была бы звучать как Мзгин или Мзгинский, а не Мзгипренская. Суффикс -ипр- в русских фамилиях не встречается, и это наводит на мысль, что перед нами либо результат описки при переписи (например, вместо «Мзгипревская» от фамилии Мзгипрев), либо фамилия, образованная от названия населённого пункта с приставкой «при-» (Мзги-при-?), что крайне редко. В любом случае, носительница фамилии Мзгипренская может считать себя потомком человека, чья фамилия была записана неверно в метрических книгах или советских паспортах — такие случаи в XX веке были массовыми. Географически фамилия почти не встречается, что подтверждает её локальный характер и возможное происхождение из одного села или одной семьи.