Фамилия Накайтите звучит для русского уха необычно, и это не случайно: её корни уходят в Литву. Это литовская фамилия, образованная по типичной для литовского языка модели с суффиксом -ите. В литовской ономастике суффикс -ите (-ytė) указывает на женский пол, то есть это девичья фамилия, которую носила незамужняя женщина или дочь. Мужской вариант той же фамилии звучал бы как Накайтис.

Основа фамилии — «Накайтис» — скорее всего, восходит к литовскому слову «nakaitis» или «nakaityti», что связано с понятием «ночь» (naktis). В старину такое прозвище могли дать человеку, который работал по ночам, например, сторожу или пастуху, пасшему скот в ночное время. Возможна и метафорическая связь: так могли назвать человека с тёмными волосами или того, кто вел ночной образ жизни.

Фамилия Накайтите — редкая за пределами Литвы. В России и других странах она встречается в основном среди потомков литовцев, переселившихся в XIX–XX веках. Обратите внимание на окончание: в отличие от русских фамилий на -ов/-ев или -ин, литовский суффикс -ите сохраняет национальную принадлежность и не склоняется по падежам как русская фамилия. Если вы встретили эту фамилию у женщины, то её предки по отцовской линии, вероятно, носили фамилию Накайтис, а сама она — представительница литовского рода, чьё прозвище закрепилось в эпоху формирования фамилий в Великом княжестве Литовском.