Фамилия Наляйкина — женская форма фамилии Наляйкин, и её происхождение уходит корнями в прозвище или мирское имя, которое вряд ли встретишь в списках распространённых. Основа здесь — «Наляйка». Слово это неочевидное, и разбирать его стоит через диалектную лексику и звуковые сдвиги.

Скорее всего, в основе лежит глагол «налякать» или «налякаться» — в южнорусских и украинских говорах это означало «напугать», «испугаться». «Наляйка» — человек пугливый, либо, напротив, тот, кто любит пугать, наводить страх. Прозвища, образованные от глаголов с приставкой «на-» и суффиксом -к(а), типичны для русской ономастики: Наляйка по той же модели, что и Напугай, Настращай. Такие имена давали в быту, и они закреплялись за человеком по заметной черте характера.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным «ляйкать» (кричать, звать) или «лякать» (пугать). Тогда «наляйка» — тот, кто накричал или нашумел. Однако приставка «на-» в этом случае даёт значение результата действия: «наляйкать» — накричать, сделать шум.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Наляйкин — сын или потомок Наляйки. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко распространены. Географически фамилия Наляйкин встречается редко, в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение.

В написании фамилии обращает на себя внимание буква «й»: Наляйкина, а не Налякина. Это не опечатка, а точная передача прозвища: «Наляйка» произносилось с отчётливым [й] перед окончанием. В старых документах могла встречаться форма «Налякин», но современный вариант закрепился как более точный фонетически.

Таким образом, фамилия Наляйкина — редкий пример прозвищной фамилии, образованной от глагола со значением страха или шума. Предок носительницы фамилии, вероятно, получил своё прозвище за пугливость или, наоборот, за привычку пугать окружающих.