Фамилия Нарынкин — одна из тех, где корень звучит не по-русски, а суффикс — родной. Основа «Нарынк-» явно восходит к тюркскому слову «нарын»: так называют узкую горную долину, ущелье, а в некоторых тюркских языках — ещё и внутренности, требуху (отсюда, кстати, и известное блюдо нарын). Но разбираться стоит не с едой, а с географией.

Самая вероятная версия: фамилия образована от прозвища Нарынка — человека, который пришёл с реки Нарын или из одноимённого города в Киргизии. Река Нарын — одна из главных водных артерий Средней Азии, и в XIX — начале XX века выходцы из тех мест нередко оседали в русских губерниях, получая прозвище по месту прежнего жительства. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Нарынкин, то есть сын или потомок Нарынки.

Менее распространённый вариант — связь с диалектным словом «нарынка» (от «нары» — возвышение, полати). В северных говорах так могли назвать высокого, долговязого человека или того, кто спал на нарах. Но эта версия слабее: тюркский корень встречается в русских фамилиях гораздо чаще, чем редкая местная лексика.

Фамилия редкая. В дореволюционных списках она почти не встречается за пределами Оренбургской и Уфимской губерний — как раз тех регионов, где русское население активно контактировало с башкирами, казахами и татарами. Это дополнительно подтверждает «среднеазиатский» след. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и казаками — в оренбургском казачьем войске людей с тюркскими прозвищами было немало.

Таким образом, Нарынкин — фамилия-топоним, которая говорит о предке, пришедшем с берегов Нарына. Другие версии (от слова «нары» или от тюркского «нарын» в значении «требуха») возможны, но менее убедительны из-за географии бытования фамилии.