Фамилия Навматуля — редкая и, на первый взгляд, загадочная. Её не встретишь в списках распространённых русских фамилий, и привычные суффиксы -ов, -ин, -ский здесь отсутствуют. Это сразу подсказывает, что перед нами не типичная «патронимическая» фамилия, образованная от имени отца, а скорее прозвищная, и пришла она, вероятно, из среды, где русский язык смешивался с другими языками — скорее всего, с украинским, белорусским или польским.

Ключ к разгадке — в основе «навмат». Она явно не славянского происхождения. Самая правдоподобная версия связывает её с греческим словом «навт» (ναύτης) — «моряк», «мореплаватель». В греческом «навт» — корень, от которого образованы слова «навигация», «наутилус». В славянских языках, особенно в юго-западных говорах, это слово могло видоизмениться: «навт» превратилось в «навмат» под влиянием местного произношения или как ироничное прозвище. Суффикс «-уля» в украинском и белорусском языках — уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный (ср. «бабуля», «мамуля», «хитруля»). Таким образом, Навматуля — это «маленький моряк», «морячок», или, возможно, прозвище человека, который ходил в море, но не был настоящим капитаном, а, скажем, юнгой или простым матросом.

Есть и более экзотическая, но менее вероятная версия. В идише существует слово «навмат» — искажённое от «навэ-мидос» (ивр. «приятный нрав»). Если фамилия имеет еврейские корни, то «Навматуля» могла быть прозвищем добродушного, покладистого человека. Однако суффикс «-уля» в еврейских фамилиях встречается редко и почти всегда как заимствование из славянской среды, так что эта версия слабее.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи: Украина, Беларусь, юг России (Причерноморье, Одесса). Носители фамилии Навматуля — это, скорее всего, потомки людей, чьи предки были связаны с морем: рыбаки, портовые рабочие, матросы торгового или военного флота. Фамилия не получила широкого распространения и осталась редкой, что типично для прозвищ, которые не стали массовыми. Сегодня её можно встретить у людей, чьи корни уходят в небольшие приморские городки или сёла, где греческое влияние или морской промысел оставили след в языке и именах.