Фамилия Назирхонов — яркий пример того, как восточное имя, пройдя через русскую канцелярию XIX века, превратилось в фамилию, привычную для жителей Таджикистана и Узбекистана. Её основа — составное арабско-персидское имя Назирхон. Первая часть, «Назир», восходит к арабскому корню со значением «предостерегающий», «увещеватель» или «надзиратель». В исламской традиции так часто называли человека, который следит за порядком или выполняет административные функции. Вторая часть, «хон» (хан), — тюркский титул, указывающий на знатное происхождение или уважение. Получается, что имя Назирхон — это «господин-надзиратель» или «уважаемый страж порядка».

Фамилию образовали по русской модели: к основе добавили суффикс -ов, который в славянской традиции означал принадлежность («чей?»). Таким образом, Назирхонов — это «сын (или потомок) Назирхона». Такое оформление тюркских и мусульманских имён стало массовым в Российской империи, когда при переписях и составлении метрических книг местным жителям записывали фамилии на русский манер. Именно поэтому фамилия распространена среди таджиков, узбеков и других народов Средней Азии, чьи земли входили в состав Туркестанского генерал-губернаторства.

Редкость фамилии в том, что она сохранила полную форму исходного имени, не сократив его до короткого Назиров. Это говорит о том, что предок носителя, вероятно, был заметной фигурой в своей общине — например, сельским старшиной, муллой или мелким чиновником, чьё двойное имя не «съела» бюрократия. Встречается также вариант написания Назирханов, где арабская буква «х» передаётся через русскую «х» без смягчения, но исходное звучание от этого не меняется.