Фамилия Назыкенова — женская форма фамилии Назыкенов, которая имеет тюркское происхождение, скорее всего, казахское или татарское. Её основа, имя или прозвище Назыкен, распадается на две части: «назык» и уменьшительно-ласкательный суффикс «-ен» (или «-кен»), характерный для многих тюркских языков. Слово «назык» (варианты: назик, нəзік) переводится с казахского и татарского как «нежный», «тонкий», «изящный» или даже «капризный». В переносном смысле так могли назвать ребёнка, который рос слабым, болезненным или, наоборот, был избалованным и требовательным. В тюркской ономастике такие имена с пожелательной или описательной функцией встречаются часто: давая ребёнку имя со значением «нежный», родители могли надеяться, что он вырастет мягким и чутким, или же, по обычаю «имён-оберегов», пытались обмануть злых духов, называя слабым того, кого хотели видеть сильным.

Сам суффикс «-ов» в окончании фамилии — это уже русское наследие, типичное для фамилий, которые оформлялись в XIX–XX веках при записи в метрические книги или советские документы. Для тюркских фамилий такая модель (основа + русский патронимический суффикс) — одна из самых распространённых в Поволжье, Приуралье и Казахстане. Ударение в фамилии, вероятно, падает на второй слог: Назыкéнова, хотя в бытовой речи встречаются варианты.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где смешаны тюркские и славянские традиции именования. Если искать аналоги, то однокоренные фамилии — Назыков, Назыковский, Назыкбаев — встречаются среди казахов и татар. Встречается также вариант Назыкенов без суффикса «-ов» (просто Назыкен), что указывает на более раннюю, нерусифицированную форму имени.

Сословной привязки у фамилии нет: её могли получить и крестьяне, и кочевники-скотоводы, и торговцы. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предки носителя этой фамилии говорили на одном из тюркских языков и жили в зоне контакта с русским делопроизводством, которое и закрепило за ними окончание «-ова».