Фамилия Некерова хранит память о прозвище дальнего предка — Некер. В её основе лежит украинское слово «некерованний», то есть «неуправляемый». Так могли назвать человека чрезмерно энергичного, с кипучим нравом, который не поддавался уговорам и жил по своей воле. Впрочем, у этого прозвища есть и второе, более прозаичное прочтение: Некером могли окрестить того, кто лишился руководящего поста, «сошёл с управления». Обе версии логично объясняют появление прозвища, и первая из них выглядит убедительнее: народные прозвища чаще отражали характер, чем карьерные неудачи.

Менее вероятна связь с островом Некер в Тихом океане у Гавайских островов. Эта версия — не более чем любопытное совпадение: маловероятно, чтобы житель украинских или южнорусских земель имел отношение к острову, открытому европейцами лишь в XIX веке.

Сама фамилия образована по типичной для восточнославянских фамилий модели: к основе Некер добавили суффикс -ов и родовое окончание -а. Первоначально форма Некеров отвечала на вопрос «чей?» и означала «сын Некера». Со временем, когда фамилии закрепились за женщинами, появился вариант Некерова — так в документах записывали жен и дочерей.

Интересно, что фамилия сохранила редкую основу: слово «некерований» не вошло в литературный русский язык и осталось диалектным, украинским. Это указывает на возможные корни семьи в украиноязычной среде или на юге России, где такое прозвище могли понять без перевода. Сегодня фамилия встречается нечасто, что делает её заметной и легко отличимой от более распространённых соседних фамилий.