Фамилия Нехейма — редкая и необычная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а еврейское, и связана она с ашкеназской традицией образования фамилий. Основа здесь — немецкое слово «Nehme» (с вариантами написания) или идишское «נעמען» (nemen — «брать», «взять»). Однако в фамилию превратилось не само действие, а, скорее всего, прозвище или компонент составного имени.

Вероятнее всего, Нехейма — это русифицированная форма фамилии, восходящей к немецкому «Nehme» или «Nehem». В таком случае перед нами вариант фамилии, образованной от прозвища, которое давали человеку по его привычке или занятию: «тот, кто берёт» (возможно, в смысле сборщика податей, торговца или даже человека с хваткой). Но есть и более конкретная версия: фамилия могла произойти от сокращённой формы библейского имени Неемия (Nehemiah, в русской традиции — Неемия). В еврейской среде было принято усекать длинные имена, и «Нехем» или «Нехам» легко превращалось в основу для фамилии с окончанием -а, которое в восточноевропейском ареале часто добавляли для адаптации к местным языкам.

Суффикс -а в конце — характерная черта для фамилий, которые зафиксировались на территориях бывшей Речи Посполитой, Украины, Белоруссии и Молдавии. Он не указывает на принадлежность (как русское -ов), а скорее является ополяченным или украинизированным окончанием. Таким образом, Нехейма — это фамилия, которая сначала бытовала в идише или немецком варианте, а затем, при записи в метрические книги или при переселении в Российскую империю, получила это «а» на конце, чтобы звучать по-местному.

В отличие от распространённых русских фамилий на -ин или -ов, Нехейма не говорит о профессии предка-крестьянина или его отчестве. Она указывает на иную социальную среду — еврейское местечко, где фамилии часто присваивались в XVIII–XIX веках по указу властей и могли быть как искусственными (красивыми, «декоративными»), так и прозвищными. «Нехейма» — из числа прозвищных, но с библейским подтекстом. Носитель такой фамилии мог быть человеком, которого в общине знали как «берущего» (например, арендатора или менялу), или потомком того, кого звали Нехем (сокращение от Неемия). Спор между этими версиями решается в пользу прозвища: фамилии от полных библейских имён обычно выглядят как Неемия, Нехамкин, а «Нехейма» с ударением на второй слог звучит скорее как прозвищное образование.

Географически фамилия почти не встречается в центральной России. Её следы ведут в черту оседлости — на западные окраины империи, где немецкий и идиш смешивались со славянскими языками. Сегодня это редкая фамилия, и её носители, скорее всего, потомки тех, кто в начале XX века мигрировал из местечек Украины или Белоруссии в крупные города или за границу.