Фамилия Ненуженко ведет начало от прозвища Ненужный, которое в старину выполняло роль так называемого «охранительного» имени. Логика предков была проста и суеверна: если назвать ребенка Ненужным, то злые духи не позарятся на него, не заберут его, а значит, дитя вырастет здоровым и желанным. Надеясь на это, родители давали сыну имя-оберег, которое сначала существовало рядом с крестильным именем, а затем в повседневной жизни и в официальных бумагах полностью его вытеснило.

Словообразовательная модель здесь типична для украинских и южнорусских фамилий: к основе Ненужен- добавили патронимический суффикс -ко. Такой суффикс указывал на родство, отвечая на вопрос «чей ты?» — то есть сын Ненужного. Подобная модель массово формировала фамилии на территории современной Украины и в прилегающих областях России, поэтому Ненуженко — фамилия с отчетливым украинским колоритом, хотя само прозвище могло возникнуть и в русской среде.

Стоит оговориться: в народе фамилию часто воспринимают как указание на ненужность человека, но это ошибка. Смысл заложен прямо противоположный — защитный. Прозвище Ненужный не приживалось бы так широко, если бы воспринималось как оскорбление. Это часть древней традиции «отрицательных» имен (Некрас, Неждан, Немил), которые должны были обмануть нечистую силу и отвести от ребенка беду.

Интересно, что фамилия не получила широкого распространения и остается сравнительно редкой. Это объясняется тем, что охранительные имена хоть и были популярны в определенных слоях, но не стали массовым явлением, как, скажем, фамилии от церковных имен. Встречается Ненуженко преимущественно в восточных областях Украины и на юге России, где украинское население исторически смешивалось с русским, а фамилии на -енко чувствовали себя особенно уверенно.