Фамилия Непомилуева — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не место, а целая жизненная ситуация, зашитая в глагол. Разбираем её с конца.

Суффикс -ев указывает на типичную русскую модель образования от прозвищ или мирских имён, оканчивающихся на мягкий согласный или -й. В данном случае основа — Непомилуй. Это не имя в церковном календаре, а прозвище-оберег, построенное по той же логике, что и Некрас, Нелюб, Немил. Смысл такой: назвать человека «Непомилованным» значило обмануть злые силы, чтобы они не позарились на того, кого якобы и так никто не жалеет. По сути, это охранительное имя, призванное отвести от ребёнка беды.

Глагольная форма «помиловать» в данном контексте означает не просто простить, а пожалеть, приласкать, проявить милость. Получается, Непомилуй — «неласковый», «не обласканный», «непрощённый». В крестьянской среде такие прозвища давали не в обиду, а по суеверию: чем хуже имя, тем крепче здоровье ребёнка. Второй вариант, менее вероятный, — прозвище взрослого человека, получившего отказ в просьбе о помиловании или снисхождении, но для фамилий такая бытовая метка встречается реже.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — там, где бытовали охранительные имена на Не- (Некрасов, Неустроев). Встречается она нечасто, что подтверждает её узколокальное происхождение: скорее всего, родоначальник был единственным носителем такого прозвища в своей волости. В документах XVII–XVIII веков можно найти варианты написания «Непомилуев» (без финального -а в женской форме), но современная норма закрепилась через женскую ветвь рода.

С точки зрения словообразования фамилия любопытна тем, что сохранила архаичную приставку не- и глагольный корень в чистом виде, без уменьшительных суффиксов. Это отличает её от более распространённых «Непомнящих» или «Негодяевых» — там основа уже ушла в сторону прилагательного или существительного. Здесь же мы слышим прямой отказ от действия: «не милуй» (не жалей). Такая конструкция редка и делает фамилию своеобразным лингвистическим артефактом, за которым стоит не просто родовое имя, а целый пласт народных верований.