Фамилия Несипбаева — редкий случай, когда происхождение почти не вызывает споров, но требует знания казахской антропонимии. Это женская форма фамилии Несипбаев, которая образована по стандартной для тюркских народов модели: к основе добавляется патронимический формант -бай (в русской передаче -баев/-баева). Формант -бай в казахских, башкирских, татарских и других фамилиях означает «богатый», «хозяин», «господин» и часто указывает на принадлежность к зажиточному роду или просто на пожелание благополучия.

Основа Несип — это арабское имя Насип (в казахском произношении Несіп), которое переводится как «доля», «судьба», «участь». В мусульманской традиции это имя связано с понятием предопределения: человек, названный Насипом, как бы получает свою счастливую долю от Всевышнего. Сочетание «Несип + бай» даёт значение «богатый судьбой» или «господин, которому выпала счастливая доля». Это типичное для казахской ономастики составное имя-пожелание, которое затем перешло в фамилию.

Географически фамилия Несипбаева (и мужская форма Несипбаев) почти целиком привязана к Казахстану, особенно к южным и западным регионам — Кызылординской, Туркестанской, Мангистауской областям. В России она встречается единично, в основном у потомков казахских переселенцев. Суффикс -ев вместо -ов в окончании (Несипбаев, а не Несипбабов) — это стандартная русификация казахских фамилий, где звук [ә] или [а] адаптируется к русскому правописанию.

Сословного аспекта у фамилии нет: в казахской среде фамилии на -бай носили не только богатые скотоводы, но и обычные кочевники — имя-пожелание было универсальным. Единственное, что выделяет эту фамилию среди множества других на -баев, — это редкость основы: имя Несип встречается в Казахстане не так часто, как, скажем, Ермек или Болат, поэтому и фамилия остаётся менее распространённой.