Фамилия Нилуфар — редкий случай в русском ономастиконе. Её носители, скорее всего, не потомки древнего боярского рода, а люди, чьи предки имели прямое отношение к Востоку. В основе фамилии лежит персидское слово «нилуфар» (نیلوفر), которое означает «лотос» или «водяная лилия». В персидской поэзии и культуре это символ чистоты, красоты и возрождения. Таким образом, если рассматривать происхождение, фамилия образована напрямую от имени или прозвища, данного человеку, возможно, за красоту, грацию или как память о восточных корнях.

Модель образования здесь нетипична для славянских фамилий. В русской традиции фамилии редко образуются от нарицательных существительных без суффиксов (-ов, -ин, -ский). Фамилия Нилуфар — это «застывшая» форма личного имени или прозвища, что характерно для фамилий тюркского, иранского и кавказского происхождения. В Закавказье и Средней Азии, где имя Нилуфар (Нилюфер, Нелуфер) встречается у женщин, оно могло стать фамилией без изменений, по принципу «как имя, так и фамилия». В русскую среду такая фамилия могла попасть через браки, переселения или через потомков людей, служивших в Российской империи из числа народов Кавказа и Средней Азии.

В отличие от множества русских фамилий, где можно проследить географию по суффиксу, фамилия Нилуфар не привязана к конкретной губернии. Она встречается рассеянно, чаще в южных регионах России, в Поволжье, а также у татар и народов Дагестана. Второй возможный путь происхождения — через тюркские языки, где слово могло трансформироваться в имя. Известно, что у османов имя Нилюфер (Nilüfer) носила мать султана Мурада I, что добавляет фамилии исторического колорита, но не делает её древнерусской.

Спорных версий немного: иногда пытаются связать фамилию с греческим корнем, но это натяжка. Гораздо вероятнее, что перед нами пример восточного имени, ставшего фамилией в русском контексте. Носителям фамилии стоит искать корни не в средневековой Руси, а в родословных, уходящих в Персию, Турцию или на Кавказ, где имя Нилуфар было распространено как женское. Фамилия не получила массового распространения и остаётся редкой, что делает её своеобразным маркером восточного происхождения семьи.