Фамилия Нимтратов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, «Нимтрат», не встречается ни в древнерусских именах, ни в распространённых прозвищах, ни в тюркских или финно-угорских заимствованиях. Вероятнее всего, перед нами искусственная или канцелярская фамилия, возникшая в среде духовенства или при переписи населения в XIX веке.

Разберём словообразовательную модель. Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую форму: «чей?» — Нимтратов, то есть сын (или потомок) Нимтрата. Но откуда взялось само имя Нимтрат? В русской традиции таких имён нет. Единственная логичная гипотеза — это переосмысление греческого или латинского слова, попавшего в семинарскую среду. В семинариях будущим священникам нередко давали фамилии, образованные от церковных терминов, названий праздников или богословских понятий. «Нимтрат» может быть искажённым «Нимврод» (библейский охотник и царь) или, что вероятнее, калькой с греческого «νημτρατος» (nēmtratos) — прилагательного, связанного с понятием «распределение» или «надел». В таком случае фамилия могла означать «относящийся к распределению» (например, церковных земель или приходов).

Другая, менее правдоподобная версия — фонетическое искажение фамилии Немчинов или Немтратов, где корень «нем-» указывал бы на происхождение от «немца» (иностранца). Однако для этого нет достаточных оснований: сочетание «имтр» нехарактерно для русских говоров, а переход «е» в «и» под ударением в такой позиции маловероятен.

География фамилии крайне узкая. Нимтратовы встречаются единично, преимущественно в центральных областях России, что косвенно подтверждает её искусственное происхождение: такие фамилии не разносились миграциями, а оставались в пределах одного уезда или даже одного села. Сословная принадлежность, скорее всего, духовная или мещанская — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Таким образом, Нимтратов — фамилия-загадка, возникшая, вероятно, в стенах духовной семинарии или при кабинетном составлении списков. Её носитель, скорее всего, потомок человека, чья фамилия была образована от малопонятного книжного слова, которое со временем утратило связь с первоначальным значением.