Фамилия Нишик — редкий случай, когда суффикс сразу выдаёт географию. Окончание -ик в русских фамилиях — почти всегда маркер западнорусских, украинских или белорусских земель. В отличие от великорусских -ов/-ев или -ин, суффикс -ик образует фамилии напрямую от прозвища или имени без патронимического посредника: Ниш + ик. То есть носитель фамилии — потомок человека, которого в быту называли Ниш.

Корень Ниш- допускает несколько объяснений, но самое вероятное лежит в диалектной лексике. В юго-западных говорах «ниш» — вариант слова «нищий», «бедняк», «попрошайка». В украинском языке «нищий» звучит как «нищий», а в белорусских говорах встречается форма «нішчы». Прозвище Ниш могли дать не обязательно из-за реальной бедности: в крестьянской среде так нередко дразнили скупого или, наоборот, того, кто постоянно просил в долг. Фамилия Нишик, таким образом, означает «потомок Ниша» — человека с прозвищем, связанным с бедностью или скупостью.

Менее вероятная версия — от тюркского имени Ниш (встречается у татар и башкир как краткая форма от Нишан, что значит «знак», «метка»). Но тогда фамилия скорее оформилась бы как Нишев или Нишин, а не Нишик. Тюркское происхождение возможно лишь в случае, если предок жил в зоне активного русско-татарского контакта и фамилию записали на слух, но это единичные случаи.

По сословному составу Нишики — почти всегда крестьяне или мещане. Дворянских родов с такой фамилией нет. Встречается фамилия в основном на западе Украины (Волынь, Подолье), в Беларуси (Гродненская, Брестская области) и в приграничных районах Польши. В России Нишики редки, чаще всего — результат поздних миграций XX века. Единственное, что можно сказать о социальном контексте: суффикс -ик в украинско-белорусской ономастике был особенно распространён среди сельских жителей, поэтому предки Нишиков — скорее всего, земледельцы или ремесленники из западных губерний.