Фамилия Низгирев образована от мирского имени Низгирь, которое давали ребенку в дохристианской традиции. Вопреки возможному впечатлению, ничего общего с «низом» или «гирей» это имя не имеет. Исходное слово — «незгода», что означало беду, несчастье или немилость. Звучит странно: зачем называть ребенка несчастьем? Но в старину это был распространенный оберег. Считалось, что если наречь младенца Низгирем (то есть «бедой»), то злые силы не позарятся на него, а настоящая беда обойдет стороной. Родные желали новорожденному счастливой судьбы, как бы откупаясь от невзгод заранее.

Смена гласной в корне — с «е» на «и» — не ошибка и не искажение, а естественный исторический процесс. В живой речи звук редуцировался, произношение упрощалось, и форма Низгирь закрепилась в обиходе. Позже, когда на Руси начали массово закрепляться фамилии, потомка человека по имени Низгирь стали записывать как Низгирев — по стандартной модели притяжательных прилагательных с суффиксом -ев, указывающим на сына или потомка.

Сам суффикс -ев в фамилии указывает на патронимическое происхождение: Низгирев буквально значит «сын Низгиря». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имен и прозвищ, оканчивающихся на мягкий согласный или -ь. Однокоренных фамилий в современных справочниках почти не встретить — Низгиревы редки, что говорит о локальном бытовании исходного имени, возможно, в отдельных северных или вятских говорах, где охотнее сохранялись архаичные формы.

Отдельного упоминания заслуживает то, что имя Низгирь не попало в святцы и никогда не было крестильным. Оно осталось в разряде мирских, бытовых прозвищ, которые использовали в семье наряду с церковным именем. Поэтому точных дат появления фамилии назвать нельзя: она возникла стихийно в среде крестьян и посадских людей не ранее XVI-XVII веков, когда фамилии начали выходить за пределы боярских родов. К известным историческим личностям с такой фамилией обратиться не получится — Низгиревы не оставили заметного следа в дворянских родословных, что лишь подтверждает их простое, народное происхождение.