Фамилия Низгутская — это женская форма фамилии Низгутский, которая образована по типичной для восточнославянской ономастики модели с суффиксом -ск-. Такие фамилии обычно указывают на географическое происхождение: предок носителя был выходцем из населённого пункта с названием Низгуты или похожим (Низгут, Низгутово, Низгутка). Суффикс -ск- вместе с окончанием -ий/-ая в русских фамилиях чаще всего оформлял прозвища дворян и духовенства, но с XVIII–XIX веков стал массово появляться у крестьян и мещан, особенно в западных губерниях Российской империи.

Сама основа фамилии — «Низгут» — неочевидна и редка. Скорее всего, это топоним, который мог возникнуть от двух корней: «низ» (низина, низкое место) и диалектного «гут» (в польском и белорусском языках — «гута», то есть стекольный завод или плавильня). В таком случае Низгуты — это поселение у стекольного завода в низине. Версия с «гут» подтверждается тем, что в Речи Посполитой и на западе современной Беларуси было много местечек с названиями на -гута (Гута, Гутово, Гутники), а приставка «низ-» указывала на рельеф. Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит прозвище Низгута — человека, который «низко гнёт» (сгибается) или «гудит низким голосом», но такая версия не находит поддержки в словарях русских прозвищ.

Географически фамилия Низгутская встречается в России и Беларуси, но крайне редко. Основной ареал — западные области (Смоленская, Брянская, Витебская), что косвенно подтверждает связь с польско-белорусским топонимом. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках эта фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении — возможно, в XIX веке при выдаче паспортов или при переходе в православие из униатства.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Низгурский, Низгунов, Низгутов — то Низгутская стоит особняком: у неё нет суффикса -ов или -ин, характерного для крестьянских фамилий центральной России, а есть «дворянский» суффикс -ск-. Это не значит, что предки были знатного рода: в XIX веке так могли записать сельского священника, учителя или отставного солдата, который жил в селе Низгуты. Точное происхождение фамилии можно было бы установить только по конкретному населённому пункту, но пока такой пункт не обнаружен ни в одном историческом справочнике.

Таким образом, фамилия Низгутская — это редкий географический маркер, указывающий на выходцев из небольшого поселения у стекольного завода в низине, скорее всего, на западе современной Беларуси или в Смоленской области.