Фамилия Низиминдинов — один из тех редких случаев, когда прозвище или имя-основа не поддаются однозначной славянской или тюркской этимологии без привлечения диалектов и заимствований. Сразу скажем: это не русская фамилия в классическом понимании, а скорее позднее образование на русский лад от нерусской основы, скорее всего — тюркской или арабо-персидской.

Разберём суффикс. Формант -ов указывает на принадлежность («чей?»), а приставка Низи- и корень -минди- наводят на мысль об арабском имени или прозвище. Наиболее вероятная версия: основа восходит к арабскому имени Низам ад-Дин (نظام الدين — «порядок веры» или «устроитель религии»). В тюркской среде это имя часто редуцировалось до форм вроде Низаметдин, Низамиддин, а затем, при адаптации в русской среде, могло пройти через стадию Низиминдин — с потерей одного «д» и упрощением звучания. Фамилия Низиминдинов в таком случае означает «потомок Низиминдина» (то есть человека, носившего это имя).

Вторая, менее правдоподобная гипотеза — связь с тюркским корнем «низ» или «низи» (низкий, приниженный) и суффиксом -минди, который мог указывать на профессию или качество (например, «низкий ростом» или «скромный»). Но арабская версия надёжнее: имена с компонентом «дин» (вера) массово встречаются у татар, башкир, казахов и других мусульманских народов России, а фамилии на -ов от них — стандартная практика XIX–XX веков.

Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в Татарстане, Башкортостане и среди татарской диаспоры в других регионах России. В дореволюционных метрических книгах её почти нет — скорее всего, это поздняя паспортная фиксация, когда при переписи или получении документа писарь записал прозвище или отчество в русском падеже. Сословно носители происходили из крестьян или мещан, не из дворянства — об этом говорит суффикс -ов, а не -ский.

Сравните с однокоренными фамилиями: Низаметдинов, Низамиев, Низамов — все они образованы от того же арабского имени, но с разными этапами редукции. Низиминдинов стоит особняком за счёт необычного стяжения «замет» в «зимин», что может быть местным диалектным произношением или ошибкой писаря, которая закрепилась в документе.