Фамилия Нктина — редкий случай, где основа не поддаётся однозначному прочтению. Слово «Нктин» не встречается ни в старых словарях, ни в современных списках прозвищ. Скорее всего, перед нами результат искажения при переписи или диалектное произношение, которое закрепилось на письме. Если отбросить суффикс -ин (указывающий на принадлежность: «чей?» — сын Нктина), остаётся корень «Нкт-», который в русском языке не имеет прямого значения.

Самая вероятная версия — фамилия образована от прозвища или имени Некта (или Нектей). В говорах «некта» могло означать «некто», «некий человек» — так могли называть пришлого, чужого или того, чьё имя не хотели называть вслух. При быстром произношении или плохом почерке писарь мог записать «Нктин» вместо «Нектин», опустив безударную гласную. Подобные сокращения встречаются в метриках XIX века, особенно в северных и сибирских губерниях, где звуки редуцировались сильнее.

Другая гипотеза связывает фамилию с греческим именем Никита (через форму Некта). В народной традиции имя Никита иногда превращалось в Некта или Нектей, а от него образовывались фамилии Нектин и, со временем, Нктин. Такая цепочка правдоподобна для крестьянских родов, где имя записывали на слух, без строгой орфографии.

Географически фамилия Нктина встречается единично — в основном в центральных областях России и на Урале. Массового распространения у неё нет, что подтверждает версию о случайном написании или локальном прозвище. По сословной принадлежности предки с такой фамилией, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами — дворянских родов с основой «Нкт» не зафиксировано.

Однокоренных фамилий практически нет, что делает Нктина уникальным ономастическим казусом. Если искать аналоги, стоит смотреть на фамилии Нектин и Нектов — они встречаются чаще и имеют ту же возможную основу. Таким образом, Нктина — это, вероятно, графический вариант более распространённой фамилии, застывший в документах из-за ошибки или местного говора.