Фамилия Нокербек — редкий случай, когда перед нами не переоформленное русскими суффиксами тюркское имя, а почти исходная форма, лишь слегка адаптированная кириллицей. Она явно восходит к мужскому личному имени Нокербек, которое сложено из двух тюркских компонентов: «нокер» (нукер) и «бек».

Слово «нукер» (ногер, нокер) в монгольских и тюркских языках означало «друг», «товарищ», «спутник», а в военной иерархии средневековой Азии — «дружинник», «воин из личной гвардии» или «слуга-оруженосец» знатного лица. Вторая часть — «бек» (бей, бий) — княжеский титул, господин, повелитель. Таким образом, имя Нокербек буквально переводится как «князь-дружинник», «господин-нукер» или «верный спутник бека». Это имя-пожелание: родители нарекали так сына, желая ему стать преданным и доблестным воином на службе у достойного правителя.

С точки зрения словообразования, фамилия Нокербек — это застывшая полная форма имени без дополнительного русского патронимического суффикса (-ов, -ев, -ин). Такие фамилии характерны для народов Северного Кавказа (особенно ногайцев, кумыков, карачаевцев, балкарцев) и некоторых групп казахов, где тюркские имена переходили в фамилии практически без изменений. В русских документах XIX — начала XX века подобные имена записывали так, как слышали, поэтому возможны варианты написания: Нокербеков, Нукебеков или Ногербеков.

Географически фамилия Нокербек с наибольшей вероятностью привязана к зоне расселения ногайцев в Дагестане, Ставрополье или Карачаево-Черкесии, а также к казахским степям. Встречаемость её крайне низкая, что говорит о происхождении от конкретного предка, носившего это имя, а не от целого рода. Носители фамилии, скорее всего, потомки воинского сословия — нукеров, составлявших костяк конных дружин местных князей.

Сравнение с однокоренными фамилиями вроде Нукеров, Бекнукеров или Ногербеков показывает, что форма без суффикса — более архаичная и прямая. Она сохранилась там, где процесс русификации фамилий был слабее или где носители сознательно не добавляли русское окончание при записи в паспорт.