Фамилия Номенат — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, и её основа не очевидна для носителя языка. Скорее всего, перед нами не исконно русская, а заимствованная фамилия, которая могла появиться на территории Российской империи через несколько путей.

Первый и самый вероятный вариант — искусственное происхождение. В духовных училищах и семинариях XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали фамилии, образованные от латинских или греческих слов. Латинское nomen означает «имя», а nominatus — «названный, именуемый». Фамилия Номенат могла быть присвоена семинаристу как благозвучная книжная фамилия по смыслу «именитый» или просто как перевод на латынь, скажем, фамилии Имянинников. Такие «семинарские» фамилии часто были длинными, необычными и не имели бытовой основы.

Второй путь — адаптация иноязычной фамилии. Носители с корнями из Западной Европы (например, французской или немецкой фамилии Noménat или Nomenat) могли попасть в Россию как специалисты, военнопленные или переселенцы. В этом случае фамилия сохранила исходное написание и произношение, а её значение нужно искать в языке-источнике. Например, во французском языке фамилия могла произойти от прозвища или топонима, но точная этимология здесь неочевидна без генеалогического исследования.

Третий, менее вероятный сценарий — происхождение от прозвища. В русских говорах слово «номенат» не зафиксировано, но теоретически оно могло возникнуть как искажённое «номинал» (нарицательное) или как шутливое прозвище грамотея, любителя «именовать» вещи. Однако такая гипотеза слаба: в крестьянской среде прозвища обычно были понятными и бытовыми, а не книжными.

Географически фамилия Номенат встречается крайне редко, в основном в центральных регионах России и в городах, где были духовные училища. Сословно её носители — скорее всего, выходцы из духовенства или интеллигенции, а не из крестьян или купцов. Без обращения к архивным метрическим книгам точное происхождение конкретной ветви установить сложно, но именно латинская «семинарская» версия выглядит наиболее логичной и распространённой для таких необычных фамилий.