Фамилия Номинханов — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает все прочие версии. Её основа — мужское имя Номинхан, которое встречается у калмыков и бурят. В этих языках «номин» означает «спокойный, тихий, мирный», а «хан» — титул правителя. Имя Номинхан, таким образом, можно перевести как «спокойный хан» или «мирный владыка». Это типичное для монгольских народов составное имя-пожелание: родители хотели, чтобы сын вырос уравновешенным и справедливым, как настоящий хан.

Словообразовательная модель здесь прозрачна. Русский суффикс -ов присоединился к основе Номинхан, превратив имя в фамилию по схеме «чей?» — «сын Номинхана». Такой способ образования фамилий у калмыков и бурят стал массовым в XIX — начале XX века, когда имперская администрация фиксировала инородческое население по русскому образцу. Поэтому Номинханов — это не прозвище по ремеслу и не топонимическая фамилия, а чисто патронимическая, от личного имени.

Географически фамилия тяготеет к Калмыкии и Бурятии, реже встречается в соседних регионах — Астраханской области, Забайкалье. Из-за редкости основы путать её с другими фамилиями почти невозможно. Единственное, что может сбить с толку, — сходство с фамилией Номинханов из того же корня «номин», но с другим суффиксом. Впрочем, в русском написании оба варианта слились в один.

Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Номинханов, хотя в устной речи калмыков и бурят ударение могло смещаться на второй слог, по законам родного языка. Для носителя фамилии это один из немногих живых маркеров, напоминающих о её степном происхождении.