Фамилия Новидонская — редкий случай в русской ономастике, где географическая основа, скорее всего, переплелась с книжным или искусственным происхождением. Разбирать её стоит не с корня, а с суффикса и модели.

Суффикс -ск- указывает на типично «дворянский» или «географический» способ образования: такие фамилии давали по названию имения, города или местности. Окончание -ая (женский род) — стандартная форма для фамилий на -ский/-ская, которая закрепилась в документах. Мужской вариант, соответственно, Новидонский.

Основа «Новидон-» не похожа на славянское прозвище или имя. В ней угадывается либо топоним, либо искусственное образование. Самая вероятная версия — фамилия происходит от названия населённого пункта. На карте России и Беларуси встречаются деревни с похожими названиями: Новидон (или Новидонка). Например, в Псковской области есть деревня Новидонка, а в Могилёвской — Новидоны. Если предки Новидонских были выходцами из такого села, фамилия закрепилась за ними как указание на родину: «из Новидона».

Менее вероятная, но допустимая версия — искусственное происхождение. В XIX веке семинаристы и священники нередко получали фамилии, составленные из латинских или греческих корней. «Новидон» можно разложить как «новый» (лат. novus) и «дар» (лат. donum) — «новый дар». Однако такая этимология натянута: в семинарских фамилиях чаще использовали цельные латинские слова (например, Сперанский — от spero «надеюсь»), а не склеивали корни. Поэтому географическое происхождение выглядит правдоподобнее.

Сословно фамилия на -ский/-ская в России чаще принадлежала дворянству или духовенству, но могла достаться и крестьянам, переселившимся из другого региона (например, из белорусских или псковских земель). Точных данных о массовом бытовании фамилии Новидонская нет: она встречается редко, в основном в центральной России и на северо-западе.

Особенность фамилии — её «прозрачность» для носителя языка: она звучит как «новый дон» или «новое дно», хотя эти ассоциации ложные. На деле это типичная «выезжая» фамилия, которая привязывает человека к конкретному месту — Новидону. Если когда-то на карте существовало имение или хутор с таким названием, то Новидонские — его бывшие владельцы или жители.