Фамилия Новишникова — женская форма фамилии Новишников. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант, поскольку именно от него образована женская форма. Новишников — фамилия, в основе которой лежит прозвище или профессиональное именование, а суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Новишника).

Корень «нов-» здесь, скорее всего, не связан с понятием «новый» в прямом смысле (как, например, в фамилии Новиков). В русских говорах слово «новишник» (или «новичник») имело конкретное значение — так называли новичка, неопытного человека, только начинающего какое-либо дело. В крестьянской среде это мог быть недавно приписанный к общине работник, в ремесленной среде — подмастерье, только входящий в цех. Однако есть и другая, более редкая версия: в некоторых регионах «новишником» называли человека, который занимался расчисткой нови — то есть целины, новой земли под пашню. Это был тяжелый и уважаемый труд, требовавший силы и выносливости.

Словообразовательная модель Новишник-ов интересна тем, что суффикс -ник в основе фамилии встречается реже, чем просто -ик или -ов. Он указывает на лицо по роду деятельности или свойству (сравните: плотник, сапожник). Сочетание -шн- в корне — это результат фонетического смягчения в говорах: «новичник» могло звучать как «новишник» (переход ч в ш перед н). Таким образом, фамилия фиксирует не книжное, а живое народное произношение.

Исторически фамилия Новишников могла бытовать в центральных и северных губерниях России, где были сильны традиции общинного земледелия и артельного труда. Встречается она и сейчас, но не массово. Если ваш предок носил прозвище Новишник, он был либо «новичком» на какой-то работе (но тогда прозвище могли дать в молодости, а закрепилось оно за родом), либо человеком, осваивавшим новые земли. Первая версия — про новичка — кажется более вероятной, потому что прозвища по возрасту и опыту давались повсеместно и часто переходили в фамилии без изменений.