Фамилия Нугис почти наверняка прибалтийского происхождения, и её разбор — хороший пример того, как литовская или латышская языковая среда перерабатывает христианские имена. В основе лежит краткая форма имени Игнас (литовское Ignas, латышское Ignats) — то есть русский аналог Игнатий. Усечение первого слога и добавление уменьшительного суффикса -ис (типичного для литовских фамилий) дало форму Нугис. Буквально: «маленький Игнас» или «сын Игнаса».

Модель образования здесь сугубо балтская. В Литве и Латвии фамилии на -ис, -ас, -ус — это не просто окончания, а показатель мужского рода в именительном падеже. Нугис стоит в одном ряду с сотнями других фамилий, образованных от христианских имён по той же схеме: Янулис, Адомонис, Пятрайтис. Если бы фамилия оформлялась по русскому образцу, она звучала бы как Игнатьев или Нугов.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу современной России. Встречается в Калининградской области, в Псковской области, а также среди потомков литовцев, переселившихся в Сибирь в XIX–XX веках. В самой Литве фамилия Nūgis (с долгой «у») тоже существует, но там возможна и другая этимология — от слова nūgė (нога, лапа), что могло быть прозвищем человека с какой-то особенностью походки или стопы. Однако для русскоязычного носителя фамилии Нугис первая версия — от имени Игнас — надёжнее и проще.