Фамилия Нуину — редчайший случай в русском ономастиконе. В ней нет ни одного славянского суффикса (-ов, -ин, -ский), которые превращают прозвище в наследственное имя. По структуре это чистая основа, застывшая в именительном падеже. Такие фамилии в русской среде почти не встречаются, а если и попадаются, то, как правило, у народов Кавказа, Поволжья или Сибири, где фамилии часто представляют собой целое слово или даже фразу без дополнительных формантов.

Скорее всего, перед нами фамилия не русского, а восточного происхождения. Вероятнее всего — тюркского или кавказского. Основа «нуину» может восходить к тюркскому личному имени или прозвищу. Например, в некоторых тюркских языках есть корень «нуй» (мир, покой) или «нур» (свет), но с усечением или местным диалектным произношением. Вторая часть «-ну» может быть аффиксом принадлежности или частью сложного имени. В дагестанских языках (например, аварском или лезгинском) часто встречаются фамилии на -у, -ну, которые обозначают «сын такого-то» или «из такого-то рода». Так что Нуину могло означать «сын Нуи» или «принадлежащий к роду Нуи».

Менее вероятная, но возможная версия — что фамилия восходит к русскому прозвищу, искажённому до неузнаваемости. Например, от диалектного «нуить» (ныть, надоедать) или от междометия «ну» с повторением. Но это спекулятивно: в центральных и северных русских говорах такие образования не фиксируются, а фамилии из междометий оформлялись бы суффиксом (Нуев, Нуйкин).

Географически фамилия Нуину почти не встречается в открытых базах данных — ни в реестрах Российской империи, ни в советских телефонных справочниках. Это подтверждает её экзотичность. Если носители и есть, то их единицы, и живут они, скорее всего, в республиках Северного Кавказа или в среде тюркоязычных народов. Точное значение прозвища-основы сегодня можно установить только через опрос старожилов конкретного села или через местные родословные предания.