Фамилия Нягакова — женская форма фамилии Нягаков, которая встречается редко и имеет довольно прозрачную, но неочевидную для неподготовленного читателя этимологию. В основе лежит слово «няга». В русских говорах, особенно северных и сибирских, «няга» означает болото, топь, трясину, зыбкое место. Человек по прозвищу Няга мог получить его за то, что жил у болота, работал на болотистых землях или, в переносном смысле, за медлительность и вязкость характера — «вязнет, как в болоте». Модель образования типична: прозвище на -а (Няга) плюс патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность: «сын Няги». Фамилия Нягаков, таким образом, означает «потомок того, кого звали Нягой».

Вторая, менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках есть слово «няг» или «нәг» (в зависимости от диалекта), означающее «род», «племя» или «кровный родственник». В этом случае прозвище Няга могло указывать на родовую принадлежность или на человека, дорожащего родственными связями. Однако географическое распространение фамилии — она чаще встречается в центральных и северных регионах России, чем в тюркоязычных — делает «болотную» версию более правдоподобной. Без специальных генеалогических изысканий конкретной семьи нельзя утверждать наверняка, но русская диалектная основа — основной кандидат.

С точки зрения словообразования, фамилия Нягакова стоит в ряду однокоренных: Нягин, Нягинский, а также более редких Нягов, Нягирев. Все они, скорее всего, восходят к тому же прозвищу Няга. Интересно, что в некоторых областях слово «няга» имело и другое значение — «неженка», «избалованный человек» (от глагола «нянчить»). Это даёт третью, сугубо бытовую версию: прозвище могли дать изнеженному, капризному ребёнку или взрослому, которого постоянно опекали. Но это значение менее устойчиво в диалектах и встречается реже, чем «болото».

Сословная принадлежность носителей фамилии Нягаков не закреплена: в разных губерниях её могли носить и крестьяне, и мещане, и однодворцы. Фамилия не дворянская и не купеческая, а скорее народная, возникшая в среде, где прозвища давали по природным особенностям местности. Женская форма Нягакова, соответственно, появилась как естественное производное при замужестве или записи в документах. Сегодня фамилия остаётся малочисленной, но её носители могут с высокой вероятностью связывать своих предков с болотистыми краями Русского Севера или средней полосы.