Фамилия Нягашкин — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская или финно-угорская, а русский суффикс -ин намертво «обрусел» необычное прозвище. Чтобы понять её происхождение, нужно сразу смотреть на корень «нягаш»: в русском языке такого слова нет, зато оно встречается в языках народов Поволжья и Урала.

Самая вероятная версия связывает фамилию с мордовским (эрзянским или мокшанским) словом «няга» — «грязь», «топь», «болото». Суффикс -ш в таком случае мог быть уменьшительным или пренебрежительным: «Нягаш» — это «грязнуля», «тот, кто вымазался», или же человек, живший у болотистого места. В тюркских языках (татарском, башкирском, чувашском) тоже есть похожие корни: например, «нягыш» может означать «слабый», «хилый» или «нежный» (от слова «нәзек» — тонкий). Тогда прозвище Нягаш давали либо болезненному ребёнку, либо, наоборот, изнеженному, капризному человеку.

Русский суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Нягашкин, то есть сын или потомок Нягаша. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я (ср. Кузьмин, Ильин). В документах XV–XVII веков, когда русские переписывали инородцев в центральных уездах, мордовские и татарские имена легко обрастали русскими окончаниями. Скорее всего, предок носителя фамилии был крещёным мордвином или татарином, получившим при крещении православное имя, но сохранившим в быту прежнее прозвище.

Географически фамилия Нягашкин должна быть привязана к регионам расселения мордвы и татар: Нижегородская область, Мордовия, Чувашия, Татарстан, Пензенская область. Встречается она крайне редко — это штучный, локальный вариант, не попавший в массовые списки.

Второстепенная, маловероятная версия выводит основу из диалектного русского глагола «нягать» (в некоторых говорах — «ныть», «плакать», «капризничать»). Но это слово почти не зафиксировано в словарях, а сам корень «няг-» не характерен для русской лексики, так что тюрко-финское происхождение остаётся главным. Фамилия Нягашкин — живое свидетельство многовекового соседства славянских и финно-угорских народов, где прозвище, данное на одном языке, стало фамилией на другом.