Фамилия Нысамбекова — женская форма фамилии Нысамбеков, и её разумнее начинать с мужского варианта, так как именно он даёт ключ к происхождению. Основа фамилии — личное имя Нысамбек, которое представляет собой типичную для тюркских народов составную конструкцию из двух частей: «Нысам» и «бек».

Первая часть, «Нысам», восходит либо к арабскому имени Нисам (Низам), что означает «порядок», «устройство», «организация», либо к имени Нусрат — «помощь», «победа». В любом случае, это арабское заимствование, пришедшее через исламскую традицию. Вторая часть — «бек» — один из самых распространённых тюркских титулов, означающий «господин», «князь», «правитель». В составе личных имён этот компонент указывал на знатное происхождение или высокий статус, но со временем стал просто популярным элементом, подчёркивающим уважение и достоинство.

Таким образом, имя Нысамбек можно перевести как «князь порядка» или «господин победы». Фамилия образована по стандартной для многих тюркских языков модели: к имени добавляется русский суффикс -ов (-ова для женщин), что произошло в период активного взаимодействия с русской административной системой, когда фамилии фиксировались в документах. Суффикс -ов здесь не несёт значения принадлежности отцу (как в русских фамилиях), а служит грамматическим маркером оформления фамилии.

Фамилия Нысамбекова почти наверняка имеет казахские или, реже, узбекские корни. Имена с компонентом «бек» особенно характерны для казахов, где они широко бытуют до сих пор. Географически носители фамилии чаще всего встречаются в южных и юго-восточных регионах Казахстана, а также среди казахской диаспоры. Предки носителя фамилии были людьми, носившими имя Нысамбек, которое, скорее всего, давалось с пожеланием ребёнку стать устроителем и лидером в своей среде. Никакого отдельного сословного или профессионального значения фамилия не имеет — она прямо указывает на личное имя основателя рода.