Фамилия Нюнечкин — из тех, что сразу привлекают внимание необычным звучанием. Её основа, «нюня», в русских говорах имела несколько значений, но все они вращаются вокруг одного смыслового ядра: плаксивый, капризный или изнеженный человек. «Нюней» или «нюником» называли того, кто часто хнычет, обижается по пустякам, ведёт себя по-детски. Слово это звукоподражательное, связанное с глаголом «нюнить» — хныкать, плакать, и в XIX веке оно было вполне употребительным, хотя и нелитературным.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: прозвище Нюнечка (уменьшительно-ласкательная форма от Нюня) плюс типичный русский суффикс принадлежности -ин. Такой суффикс обычно указывал на родство: Нюнечкин — значит «сын Нюнечки» или «человек из семьи Нюнечки». В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от полных имён, прозвищные фамилии на -ин нередко закреплялись за людьми, чьё прозвище оканчивалось на гласный или мягкий согласный.

Интересно, что фамилия Нюнечкин — относительно редкая. В официальных справочниках и телефонных книгах она встречается нечасто, но её можно найти в Воронежской, Ростовской областях и на юге России. Эта география не случайна: южнорусские говоры активнее сохраняли слово «нюня» в бытовой речи. В северных и центральных областях чаще употребляли «рева», «плакса», «хныка».

В отличие от фамилий, образованных от канонических имён (Иванов, Петров), Нюнечкин — чисто прозвищная фамилия. Она не несёт в себе указания на сословие или профессию. Её носитель в прошлом — скорее всего, крестьянин или мещанин, получивший прозвище за характер, а не за ремесло. Спорных версий происхождения у этой фамилии почти нет: корень «нюн-» настолько ясен, что альтернативные объяснения (например, от тюркского корня) выглядят натяжкой и не подтверждаются диалектными данными.

Есть у этой фамилии и любопытная параллель: однокоренные Нюнин, Нюхов, Нюхин, а также более редкие Нюнькин и Нюнчик. Все они образованы от того же прозвищного гнезда, но с разными суффиксами. Нюнечкин стоит особняком благодаря двойному суффиксу — уменьшительному -ечк- и притяжательному -ин-, что делает её одновременно и «детской» по форме, и вполне серьёзной по словообразовательной логике.