Фамилия Онкес резко выделяется на фоне типичных русских фамилий. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, а основа звучит иноязычно. Это верный признак того, что фамилия пришла в русский язык извне и, скорее всего, не славянского происхождения.

Наиболее вероятная версия — немецкие или голландские корни. Фамилия Онкес могла возникнуть как патроним (по отцу) от имени Онке, которое, в свою очередь, является краткой формой личного имени Онно. В германской ономастике имя Онно (или Онне) имеет древневерхненемецкое происхождение и связано со словом «ahha» — вода, река. Таким образом, Онкес могло означать «сын Онке» или «потомок Онно». Суффикс -ес характерен для фамилий северной Германии и Нидерландов, где он выполняет ту же функцию, что и русский -ов: указывает на принадлежность роду.

Вторая версия, менее распространенная, но возможная — еврейское происхождение. В ашкеназской традиции фамилия Онкес могла быть образована от ивритского имени, например, от аббревиатуры или прозвища, но звучание ближе к германскому типу. В любом случае, носители фамилии Онкес в Российской империи — это, скорее всего, потомки немецких колонистов, переселявшихся в Поволжье и на юг России в XVIII–XIX веках, или выходцы из Прибалтики, где немецкое влияние было сильным.

Географически фамилия Онкес в дореволюционной России была редкой и фиксировалась преимущественно в тех губерниях, где существовали немецкие колонии — Саратовской, Самарской, Таврической, а также в Санкт-Петербурге. Со временем фамилия обрусела, но сохранила свою уникальную, нехарактерную для русского уха форму, что делает ее ярким маркером миграционных процессов в истории страны.