Фамилия Опрофат — редкая и нестандартная для русского ономастикона. В ней нет привычных славянских суффиксов (-ов, -ин, -ский), которые сразу указывают на принадлежность к роду. Скорее всего, перед нами искусственное или книжное образование, и чтобы понять её происхождение, придётся отбросить шаблон крестьянской или дворянской фамилии по отцу или прозвищу.

Первый и самый вероятный путь — латинский или греческий корень. Фамилия могла возникнуть в среде духовенства, где было принято давать семинаристам «говорящие» фамилии на латыни или греческом. Опрофат (Opraphat) может быть искажённым написанием от латинского «oprophatum» — причастие со значением «осуждённый», «порицаемый», или от греческого «οπροφατ» (не встречается в классических словарях, но возможно как вариант передачи «опрафат» — «тот, кто отвергнут»). В таком случае фамилия могла быть дана ученику семинарии за какой-то проступок или, наоборот, как смиренное самоназвание.

Вторая версия — топонимическая. В некоторых говорах русского севера и Приуралья встречается слово «опрофат» в значении «оборванец», «неопрятный человек». Это местное прозвище, которое могло закрепиться за крестьянином, жившим в бедности. Однако распространённость такого прозвища крайне мала, и письменных фиксаций почти нет.

Третья, менее правдоподобная гипотеза — искажение при переписи. Фамилия могла возникнуть из-за ошибки писаря при записи какой-нибудь более частой фамилии вроде Опрофанов, Опрохоров или Апрофат. Но тогда исходная форма должна была быть стёрта временем, а Опрофат остался в единственном экземпляре.

География бытования фамилии не прослеживается: носители единичны, и в дореволюционных списках она не значится. Скорее всего, фамилия Опрофат — это редкий случай семинарской или искусственной фамилии, которая не прижилась в массовом обиходе. Её носитель мог быть выходцем из духовного сословия, но точных данных нет. Единственное, что можно сказать с уверенностью: основа фамилии не славянская, а заимствованная, и её значение, если верить латинской версии, связано с понятием осуждения или отвержения.