Фамилия Опруненко — яркий пример украинской модели образования, где суффикс -енко указывает на сына или потомка. В основе лежит личное имя или прозвище Опрун, которое само по себе — загадка для неподготовленного глаза. Скорее всего, это диалектная или просторечная форма крестильного имени Амвросий (в обиходе — Абросим, Аброня, Оброня). Украинская фонетика могла превратить «Оброня» в «Опруня» через замену «б» на «п» (явление, известное в говорах как ассимиляция по глухости) и стяжение гласных. Таким образом, Опруненко — буквально «сын Опруна», то есть потомок человека по имени Амвросий.

Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «опрунити» — в некоторых южнорусских и украинских говорах так могли сказать об упрямом или несговорчивом человеке, который «упирается». Тогда прозвище Опрун закрепилось бы за строптивым, своенравным предком. Однако первая версия — от имени — выглядит надёжнее, так как фамилии на -енко в массе своей образовывались именно от имён, а не от бытовых прозвищ.

Фамилия редкая. Её география — преимущественно центральные и восточные области Украины, откуда она могла распространиться на юг России и в Краснодарский край. Суффикс -енко не оставляет сомнений в социальном происхождении носителей: в XVII–XIX веках такую фамилию носили казаки, крестьяне и мещане, а не дворяне, у которых преобладали фамилии на -ов/-ев и -ский.

В написании возможна путаница: иногда встречается вариант «Апруненко» — с начальной «А», что отражает акающее произношение в южнорусских говорах. Но исторически верная форма — через «О», так как она восходит к имени.