Фамилия Ойшыбаева — женская форма фамилии Ойшыбаев. Её основа — тюркское мужское имя или прозвище Ойшыбай. Оно составное: первая часть «ойшы» восходит к казахскому или киргизскому слову «ойшы» — «мыслитель», «думающий», «мечтатель», от глагола «ойлау» (думать). Вторая часть «бай» — распространённый тюркский титул «богатый, господин, хозяин». Таким образом, Ойшыбай — «богатый мыслями» или «мудрый господин». Это имя давали с пожеланием ума и достатка.

Фамилия образована по продуктивной для тюркских языков модели: к основе добавляется русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягких и шипящих основ). В казахской и киргизской среде такие фамилии появились в XIX — начале XX века, в период русификации, когда к местным именам прикрепляли стандартные русские окончания. Окончание -а указывает на принадлежность женщине: дочери или жене Ойшыбая.

Фамилия редкая и географически привязана к Центральной Азии, в первую очередь к Казахстану и Киргизии. Встречается также в смешанных русско-тюркских регионах России. Носительницы фамилии Ойшыбаева — потомки людей, которых в роду называли Ойшыбаем: вероятно, это был уважаемый старейшина, аксакал, известный рассудительностью. Сословно предки относились к свободным скотоводам или земледельцам, реже — к родовой знати, так как компонент «бай» указывает на состоятельность.

В написании возможны варианты: Ойшыбаева (с буквой «ы» после «ш») и Ойшибаева (с «и» — русифицированная форма). Первый вариант точнее передаёт тюркское произношение. Сравнение с однокоренными фамилиями (Ойшыбеков, Ойшыбаев) показывает, что корень «ойшы» устойчив и не смешивается с другими тюркскими корнями, например с «ой» (яма, низина). Споров о происхождении нет: фамилия прозрачная, без альтернативных версий.