Фамилия Пабарисов — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, географическое или этническое прозвище. Самое правдоподобное объяснение отсылает нас к латышскому языку. В Латвии есть слово «pabaris» — так называли жителя окрестностей города Бауска, то есть человека «под Бауской» или из Пабари. Суффикс -ис- в таком случае — это русифицированное окончание латышской фамилии на -ис, которое при записи в российских документах превратилось в -ов. Таким образом, Пабарисов — это сын человека по прозвищу Пабарис, то есть выходец из исторической области Семигалия на юге Латвии.

Вторая версия, менее вероятная, но встречающаяся в ономастике, связывает фамилию с личным именем Пабарий. Это имя могло быть народной формой канонического имени Павел или производным от греческого «папас» (отец, батюшка). Однако в русских святцах имени Пабарий нет, а фамилии на -исов чаще указывают на балтийское происхождение, поэтому версия с «латышским следом» выглядит убедительнее.

Словообразовательная модель проста: основа «Пабарис» + патронимический суффикс -ов, который означает «чей?» — принадлежащий Пабарису. Фамилия не получила широкого распространения и осталась локальной. Её носители, вероятно, были выходцами из крестьян или мещан западных губерний Российской империи (Курляндской, Лифляндской), где жили латыши и литовцы. В XX веке фамилия встречается спорадически, в основном на Северо-Западе России и в Прибалтике, что подтверждает её узкую географическую привязку.