Фамилия Пагаджельский — редкий случай, когда географическая основа почти наверняка перевешивает любую другую версию. Её польское происхождение выдают два маркера: суффикс -ский (в польской традиции -ski, указывающий на шляхетское или топонимическое происхождение) и корень, который не поддаётся прямому переводу с русского или украинского. Носитель такой фамилии, скорее всего, потомок человека, владевшего или жившего в местечке с названием вроде Пагаджель, Пагодзель или Пагоджель.

Попытки разложить фамилию на славянские «пагад» или «погад» (в значении «гадкий», «нечистый») малоправдоподобны. Фамилии на -ский редко образовывались напрямую от прозвищ с отрицательной коннотацией — дворянство и шляхта предпочитали брать фамилии по имени имения, а не по личному недостатку. Гораздо реалистичнее видеть в основе топоним, который мог возникнуть от балтийского или ятвяжского корня (например, литовское pagadis — «подлесок», «опушка», или pagud — «место у брода»). В пограничных землях современной Польши, Беларуси и Литвы такие названия не редкость.

Модель образования проста: владелец фольварка Пагаджель (или выходец из села Пагодзель) получал фамилию по месту жительства. Суффикс -ский в польском варианте — это аналог русского -ский, но с более сильной привязкой к землевладению. Если бы фамилия была русской, она скорее звучала бы как Пагаджельский (с тем же суффиксом) или Пагаджелев (с суффиксом -ев, указывающим на отчество от прозвища).

Сословно, скорее всего, это мелкая шляхта или однодворцы (потомки служилых людей, записанных в дворянство, но не имевших крепостных). В Российской империи после разделов Польши многие носители таких фамилий оказались в списках дворянства западных губерний — Волынской, Гродненской, Минской. Точных данных о количестве носителей сегодня нет, но фамилия остаётся крайне редкой, что подтверждает её узкое локальное происхождение.

Особенность написания — ударение, скорее всего, на втором слоге (Пага́джельский), хотя в польском варианте могло быть и на предпоследнем (Пагадже́льски). В русском языке фамилия сохранила польский суффикс без адаптации, что говорит о её позднем закреплении в документах уже после перехода носителей в православие или русское подданство.