Фамилия Пагегала — редкая и нестандартная для русского уха, и её разговор стоит начать с самого очевидного: она не вписывается в привычные словообразовательные модели русских фамилий. В ней нет типичных суффиксов -ов, -ин, -ский, которые указывали бы на происхождение от имени или прозвища отца. Это сразу наводит на мысль, что корни фамилии иноязычные, и, скорее всего, она принадлежит к числу фамилий, которые в русском языке закрепились в неизменной форме.

Наиболее вероятная версия — литовское или жемайтское происхождение. В литовском языке есть слово «pagėgala» (или «pagėgė»), которое связано с понятием «сила», «мощь», «способность». В основе лежит корень «gėg-» или «gag-», означающий «быть в состоянии», «мочь». Фамилия могла возникнуть как прозвище сильного, крепкого человека, того, кто «может», справляется с делами. Суффикс «-ala» в литовской антропонимии — распространённый способ образования прозвищ (сравните с фамилиями Гирдала, Буткус). Таким образом, Пагегала могло означать «силач» или «умелец».

Вторая, менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с географическим названием. В Литве есть топоним Pagėgiai (Пагегяй) — город и район. Фамилия могла образоваться от названия местности, указывая на выходца из этих мест: «тот, кто из Пагегяй». Учитывая, что фамилия встречается в основном в западной Беларуси, на границе с Литвой, и в самой Литве, эта версия не лишена оснований.

В русском контексте фамилия Пагегала — пример того, как иноязычная основа сохраняла свою форму без русификации. Носители этой фамилии, вероятно, были выходцами из литовских или белорусских земель, где ещё в XIX веке активно бытовали прозвища на -ала. Склоняется она по правилам мужского рода: Пагегала, Пагегалы, Пагегале, хотя в разговорной речи иногда встречается и несклоняемый вариант. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией не зафиксировано, что говорит о её локальном, крестьянском или мещанском происхождении.