Фамилия Панетков — редкая, и её разговорный, почти «домашний» суффикс -ков выдаёт в ней позднюю, скорее всего, северную или сибирскую модель образования. В официальных документах XVIII–XIX веков такие фамилии часто писали «на вырост»: от простого деревенского прозвища делали фамилию по образцу дворянских, но с простонародным окончанием.

Основа фамилии — Панетко. Это некалендарное имя или прозвище, образованное от канонического имени Пантелеймон (в просторечии — Пантелей, Пантя, Паня). Суффикс -етко (или -етка) в восточнославянской антропонимии — уменьшительно-ласкательный, как в формах Ефимко, Петрушко, но с дополнительным оттенком «сын такого-то» или «маленький, молодой». То есть Панетко — это «маленький Паня» или «сын Пани», а Панетков, соответственно, — «чей? — Панетков». Фамилия отвечает на вопрос «чьих будете?»: потомок человека по прозвищу Панетко.

Вторая, менее вероятная версия выводит основу от диалектного глагола «панеть» (падать духом, хиреть) или от слова «панетка» (вид одежды, накидка). Но для фамилии это нетипично: прозвища от глаголов обычно давали по действию (Панюха, Панька), а не по отвлечённому состоянию. Поэтому версия с производным от Пантелеймона — основная.

Географически фамилия Панетков встречается точечно: в Воронежской области, на Среднем Урале и в Сибири. Это указывает на позднее переселение крестьян в XIX веке — либо из чернозёмной полосы на восток, либо из северных губерний, где были распространены фамилии на -ков от имён на -ко.

Сословно Панетковы, скорее всего, государственные или экономические крестьяне. Дворянской ветви у этой фамилии нет: слишком «простая» модель образования и отсутствие в родословных книгах. В списках однодворцев или казаков фамилия тоже не засветилась — значит, предки не несли регулярной службы, а пахали землю или работали на промыслах.