Фамилия Панучкин, предположительно, образована от имени Панучка, которое может быть производной формой имени Павел. Оно в переводе с латинского означает «маленький». Также не исключено, что имя Панучка является просторечным вариантом имени Пантелеймон (от греческого «всемилостивый»), Панкрат (от греческого «всемогущий») или Панфил (от греческого «всеми любимый»). Таким образом, потомок человека, которого звали Панучка, со временем получил фамилию Панучкин.