Фамилия Пайдютова — редкий случай, когда географический разрез даёт больше, чем этимологический. Если судить по ареалу, она почти наверняка происходит из среды коми-пермяков или коми-зырян. Основа «Пайдют» (или «Пайдуд») не имеет прозрачной славянской этимологии, зато хорошо ложится на финно-угорскую почву. В коми языке «пай» означает «доля», «часть» или «кусок», а «дют» может быть искажением «дöд» — «сани», либо «дöр» — «край», «берег». Правдоподобнее версия с «дöд»: Пайдют — человек, который получал долю с саней, то есть, скорее всего, возчик или извозчик на зимнем пути. Альтернатива — прозвище по месту жительства: «живущий на краю своей доли» (наделе).

Суффикс «-ов» в фамилии — чисто русский патронимический формант, который на Севере и в Приуралье часто прикрепляли к иноязычным основам при переходе в православие и записи в метрики. То есть Пайдютова — это «дочь (или жена) Пайдюта». Фамилия женская по форме, но мужской вариант Пайдютов встречается так же редко и локально.

Спорных версий немного. Можно предположить, что «Пайдют» — это вариант написания фамилии Пайдутова от тюркского «байдут» («богатый обычаем»), но в таком случае фамилия была бы распространена среди татар или башкир, а не в коми-пермяцких районах. Поэтому финно-угорская версия надёжнее.

Социальный контекст фамилии — крестьянский. В XIX веке носители фамилии Пайдютовы фиксируются в основном в Чердынском уезде Пермской губернии и в соседних волостях Вятской губернии. Это зона северного земледелия и лесных промыслов, где извоз (особенно санный) был сезонным, но важным заработком. Фамилия не дворянская, не купеческая — она указывает на человека, который кормился своей лошадью и санями, а не на владельца капитала. В советское время фамилия почти не вышла за пределы исторического ареала, поэтому и сегодня её носители чаще всего живут в Пермском крае и соседних регионах.