Фамилия Пектопедоров — редкая и сложная для односложного толкования. В ней не сразу угадывается ни ремесло, ни географическое название. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать её по составу, отбросив типичный русский суффикс принадлежности.

Основа фамилии — Пектопедор. Это не имя и не прозвище из живого русского языка. Скорее всего, перед нами искусственная или книжная фамилия, образованная от греческих корней. В ней угадываются два слова: «пектос» (πɘкτός) — «застывший, сгустившийся» (от глагола «пекто» — «свертывать, застывать»), и «педор» (παιδορ) — форма, связанная с «пайс, педос» (παις, παιδός) — «дитя, мальчик, сын». Таким образом, буквальное значение могло быть «застывшее дитя» или «крепкий ребенок». Однако в бытовой ономастике такие сложные греческие конструкции редки и, как правило, принадлежат среде духовенства.

В России фамилии на -ов, образованные от греческих слов, часто давали в семинариях. Священники, стремясь к благозвучию или назидательности, переводили русские прозвища на греческий или конструировали новые. Вероятно, исходное русское прозвище предка звучало как «Крепыш» или «Твердыш» (от «пектос» — крепкий, твердый), а «педор» указывало на молодость или сыновнюю принадлежность. В сумме фамилия могла означать «сын крепкого» или «твердый сын». Семинарские фамилии нередко были громоздкими и искусственными, поэтому Пектопедоров — типичный образец такой «ученой» фамилии.

Другая, менее вероятная версия, связывает фамилию с диалектным или искаженным словом. В некоторых говорах «пекто» означало «печь», а «педор» могло быть формой имени Фёдор (Педор — просторечное). Тогда Пектопедоров — это «Печной Фёдоров», то есть сын Фёдора, который работал у печи. Но эта версия слаба: сочетание «пекто-» с русским именем в такой конструкции неестественно, а греческий корень «пектос» здесь выглядит чужеродно.

География фамилии крайне узкая. Пектопедоровы встречаются эпизодически, в основном на юге России и в центральных областях, где было много семинарий (например, в Воронежской, Курской губерниях). В документах XIX века фамилия не фиксируется массово, что подтверждает её книжное, а не крестьянское происхождение.

Итог: перед нами редкая фамилия, почти наверняка семинарского происхождения. Её основа — греческое словосочетание со значением «крепкий ребенок» или «сын крепкого». Носитель такой фамилии в прошлом, скорее всего, происходил из семьи священнослужителя или получил фамилию при обучении в духовном училище.