Фамилия Перошкиер — редкая и, скорее всего, искусственная по происхождению, что сразу выделяет её из массы крестьянских или дворянских фамилий, образованных от имён и прозвищ. Слово явно не вписывается в типичную русскую модель с суффиксами -ов, -ин или -ский. Основа «перо» и окончание «-шкер» заставляют предполагать, что перед нами фамилия, созданная в учебном или литературном контексте, например, в среде семинаристов или гимназистов. В духовных училищах XVIII–XIX веков было принято давать будущим священникам благозвучные фамилии на латинский или греческий манер, часто с намёком на какое-либо качество или предмет.

Вероятнее всего, Перошкиер — это русифицированная версия латинизированного слова. «Перо» в русском языке — это инструмент для письма, а суффикс «-шкер» может быть искажением или переосмыслением латинского суффикса -arius (или -scher в немецком варианте), обозначающего деятеля. Таким образом, фамилия могла означать «писарь», «переписчик» или «тот, кто работает пером». В семинарской среде такие фамилии давали ученикам, отличавшимся каллиграфическим почерком или любовью к сочинительству. Второй вариант — происхождение от немецкого слова Feder (перо) и суффикса -schker, что также указывает на профессию писца, но с немецким акцентом.

Географически фамилия могла закрепиться на западе Российской империи, в областях с немецким или польским влиянием, либо в среде русифицированных немцев. Встречается она крайне редко, и её носители, скорее всего, были либо мелкими чиновниками, либо людьми умственного труда, а не крестьянами. Других версий, например, от еврейского или тюркского корня, нет, так как звуковой состав и значение «перо» слишком прозрачны.