Фамилия Подчишинская — женская форма от Подчишинский, но в быту чаще всего именно так и записана: с окончанием -ая. Сразу бросается в глаза суффикс -ск-, типичный для польской, белорусской и украинской шляхты, а также для русских фамилий, образованных от географических названий. Подчишинский — это человек из Подчишина, Подчишина или Подчишино. Вопрос в том, где искать это место.

Скорее всего, корень «чиш» восходит к польскому «cisz» — тишина. В таком случае Подчишино — это «место под тишиной», то есть глухое, укромное селение, спрятанное от дорог и шума. В польской ономастике фамилии на -иский/-ский с приставкой Под- указывают на расположение усадьбы или хутора: Подчишинский — тот, чей дом стоял под тихим местом, у тихой речки или в низине, где ветра нет. Однако возможна и вторая, более прозаичная версия: основа «чиш» — это искажённое диалектное «чиж» (птица). Тогда Подчишинский — это человек из села, где водились чижи, или прозвище по птице, но с географическим переосмыслением.

Фамилия редкая, встречается в основном на западе современной России, в Беларуси и на востоке Польши. В дореволюционных метриках её носители — мещане и однодворцы, реже крестьяне. Дворянского герба Подчишинские, скорее всего, не имели: фамилия образовалась поздно, в XVIII–XIX веках, когда польская шляхта массово получала фамилии по названиям имений. Если имение было мелким и не внесённым в гербовники, фамилия оставалась «простой». По суффиксу -ск- можно предположить, что предки принадлежали к мелкопоместной шляхте или к категории так называемых «чиншевиков» — арендаторов земли.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: приставка под-, корень чиш, суффикс принадлежности -ин-, фамильный суффикс -ск- и окончание -ая. Ударение в исходной форме, вероятно, падало на второй слог: Подчи́шинская. В разговорной речи нередко смещается на окончание, но это уже местная особенность.