Фамилия Подухайло — одна из тех, где прозвище-основа считывается почти сразу, но её точный смысл ускользает из-за диалектной и исторической многозначности корня. В ней отчётливо видна украинская или южнорусская словообразовательная модель: глагольная основа в повелительном наклонении плюс суффикс -айло. Этот суффикс в восточнославянских прозвищах часто обозначал деятеля с оттенком иронии или постоянного действия: «кричи, да так, что аж закладывает» — Кричайло, «долби одно и то же» — Долбайло. Подухайло стоит в том же ряду.

Попробуем разобрать глагол «подухать». В литературном русском языке его нет, зато в украинском «подухати» означает «подуть», «повеять». В говорах юга России и Белоруссии «духать» — то же, что «дуть». Тогда Подухайло — это человек, который «подувает», например, на горячий чай или раздувает угли в кузнечном горне. Прозвище могло прицепиться к кузнецу, стеклодуву или просто к тому, кто имел привычку сильно дуть. Однако есть и другая, менее очевидная версия: в некоторых диалектах «духать» означало «тяжело дышать», «пыхтеть». В этом случае Подухайло — насмешливое прозвище одышечного, полного или суетливого человека.

География фамилии подтверждает её южное происхождение. Основная масса носителей Подухайло исторически зафиксирована на территории бывшей Черниговской губернии, в современной Сумской области Украины, а также в прилегающих районах Брянской и Курской областей России. Это регион, где украинское влияние на говор и фамильные модели было очень сильным. Фамилия не стала массовой и осталась довольно редкой — это указывает на то, что она возникла как индивидуальное деревенское прозвище, а не как фамилия от крестильного имени.

Сословно носители Подухайло почти наверняка были крестьянами или казаками. Никаких следов дворянского происхождения или попадания в родословные книги эта фамилия не имеет — она из той среды, где прозвище давали метко и навсегда. Единственная морфологическая особенность, которую стоит отметить: фамилия не склоняется по женскому роду в традиционной русской схеме (она не становится «Подухайлова», а остаётся неизменной), что тоже типично для украинских образований на -айло.