Фамилия Поебень — одна из тех, где исходное слово настолько яркое и неудобное для современного уха, что сразу хочется найти более благозвучное объяснение. Но ономастика — наука честная, и притягивать за уши «древнескандинавские корни» или «искажённое греческое имя» здесь не стоит. Основа фамилии — глагол «поебать» (в значении «побить, поколотить, сильно изругать») или существительное «поебень» (ерунда, чепуха, нечто несерьёзное). Оба слова фиксируются в русских говорах, особенно северных и сибирских, и оба имеют грубоватый, но бытовой характер.

Словообразовательная модель проста: фамилия образована без суффикса, напрямую от прозвища. Это так называемые «нулевые» фамилии, которые встречаются реже, чем патронимы на -ов или -ин. В дореволюционной России их могли записать в метрику именно так — как есть, без добавления суффикса, особенно если прозвище было распространённым в данной местности. Прозвище Поебень мог получить человек, который любил говорить ерунду, либо тот, кто славился крутым нравом и склонностью к драке. В некоторых говорах «поебень» означала ещё и брань, ругань, так что прозвище могло закрепиться за сварливым или сквернословящим человеком.

Географически фамилия тяготеет к северным областям России — Архангельской, Вологодской, отчасти к Пермскому краю. В этих местах лексика с корнем «еб-» была более обыденной и не воспринималась как мат в современном смысле; она входила в состав множества прозвищ и фамилий (ср. Ебалов, Ебаков, Поебеньщиков). В переписях XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с подобными фамилиями — сословно это были, скорее всего, черносошные крестьяне или ремесленники, а не дворяне.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Поебень — более редкая форма. Чаще встречается Поебеньев или Поебеньский, где суффикс «смягчает» звучание. Фамилия без суффикса — архаичная, она сохранила исходную огласовку прозвища. В современных базах данных носителей фамилии немного, и они в основном сосредоточены в тех же северных регионах, что подтверждает её локальное происхождение.

Никакой трагедии или тайны в этой фамилии нет. Прозвище было бытовым, не оскорбительным для своего времени, а фамилия закрепилась за потомками так же, как закрепились тысячи других «неприличных» на современный взгляд фамилий.