Фамилия Поляйкина, при всей своей редкости, строится по прозрачной и типичной для русского севера модели. В её основе лежит нецерковное имя или прозвище Поляйка. Суффикс -к- в таких именах (ср. Ванька, Гришка, Митька) выполнял уменьшительно-уничижительную или, наоборот, обиходно-ласкательную функцию. Само имя Поляйка — это производное от канонического имени Полиевкт (греч. «многовожделенный») или, что правдоподобнее, от народной формы Полуект. В русском быту сложные греческие имена часто сокращали до первого слога: Полиевкт превращался в Поля, а затем в Поляйку.

Притяжательный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Поляйкин. Значит, предок носительницы фамилии был известен в своей общине как Поляйка — либо по имени, либо по прозвищу. Второй вариант исключать нельзя: в северных и сибирских говорах «поляйкать» означало «болтать, пустословить, калякать». Прозвище Поляйка мог получить говорун или балагур. Если же отталкиваться от имени, то Полиевкт — имя редкое, преимущественно монашеское, и крестьянин с таким именем — явление нечастое, что делает фамилию ещё более локальной.

Географически фамилия Поляйкина тяготеет к Вологодской, Архангельской областям и северу Кировской области. Именно там, в зоне бытования «окающих» говоров, безударное «о» в имени Полуект легко переходило в «а» на письме, закрепляя форму Поляйка. Фамилия почти не встречается за пределами Русского Севера, что выдаёт в ней потомка старинного северного крестьянства, возможно, черносошного (свободного, не крепостного).

Важно не путать Поляйкину с фамилией Полейкина. Вторая происходит от имени Полей — сокращения от Аполлон или Ипполит, и распространена шире. Поляйкина же — более редкий вариант, сохранивший архаичный суффикс -ай- (Поляй вместо Поля), который в XVI–XVII веках был характерен для северных писцовых книг. Таким образом, фамилия звучит как живой диалектный слепок: имя, пройдя через народное произношение и местную словообразовательную привычку, застыло в фамилии.