Фамилия Помешалкина образована от мужского варианта Помешалкин, а тот, в свою очередь, — от прозвища Помешалка. В основе лежит глагол «помешать» в прямом, бытовом смысле. Чаще всего так называли человека, который постоянно мешал, путался под ногами, вмешивался не в своё дело. Прозвище давалось не столько со зла, сколько с долей иронии или бытовой укоризны.

Словообразовательная модель здесь редкая. Суффикс -к- в основе прозвища указывает на предмет или орудие действия. Помешалка — это не просто «тот, кто мешает», а «та помеха, которая постоянно рядом». Такие прозвища по поведению — одни из самых древних в русской ономастике, они могли закрепиться за человеком в любом сословии, от крестьянина до ремесленника. Модель с суффиксом -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Помешалкин, то есть сын или потомок Помешалки.

Географически фамилия встречается нечасто, но имеет очаги в центральных областях России и в Поволжье. Встречаются единичные записи по Вятке и Пермской губернии — там, где активно бытовали прозвищные фамилии на -ин и -их. В отличие от фамилий от профессий или крестильных имён, Помешалкина — яркий пример «характерологической» фамилии: она прямо говорит о поведении предка. Никакой тайны тут нет, но именно эта прямота и есть её ценность для историка быта.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Мешалкин, Мешалов), то Помешалкина стоит особняком: приставка по- смягчает значение, делая его не столько грубым, сколько бытовым, почти ласковым. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные прозвищные фамилии на -ка и -алка разбираются как типичные для северных и центральных говоров, где активен суффикс -к- в прозвищах.